生信分析最好的系统架构:个人观点

1. 宿主机系统

  • 结论:CentOS7.9,宿主机的最佳主系统。推荐安装 Server with GUI。
  • 优点:
    1. 兼容各种外接硬件,包括磁盘、GPU等扩展。目前为止,CentOS硬件驱动等支持目前是最好的,这也是众多IT企业选择它的原因。
    2. 稳定,安全,且用户广泛,出问题容易搜到参考答案。
    3. 久经考验的软件组合。
  • 缺点:
    1. CentOS7.9 支持快到期了,2024.6月。
    2. 久经考验==很落后,gcc及众多共享库还是十年前的版本!基本无法满足工作需要。

2. 工作系统

  • 结论:Ubuntu22.04 就是次新的ubuntu长维护版本
  • 优点:
    1. gcc和共享库都很新!安装很多包和依赖就走默认即可,相当于节约了大量debug和安装包的时间。
  • 缺点:
    1. 可能不利于用户提升linux折腾技能。因为没了各种zlib、gcc等库的折腾,用着太丝滑了。
    2. 太新的软件和库有无法预知的安全漏洞的风险。

3. 怎么结合起来

  • 宿主机用CentOS系统
  • 安装docker,构建Ubuntu容器
  • 容器内外做好端口映射-p和文件映射-v
  • 缺点:灵活性的代价,是硬盘占用的增多。不过相对于节约的时间,简直太十分划算啦!

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